청약통장에 넣은 돈도 연말정산 소득공제가 된다 — 무주택 세대주 요건과 연 300만원 납입 한도

청약통장은 대개 아파트 청약 자격을 유지하려고 매달 몇 만원씩 넣어 두는 통장으로 여겨집니다. 그런데 같은 통장에 넣은 돈이 근로소득에서 공제되어 세금을 줄여 준다는 사실은 의외로 잘 알려져 있지 않습니다. 알고 있더라도 세대주가 아니어서, 혹은 집을 판 지 얼마 안 되어서 대상이 되는지 헷갈려 하다가 신청을 건너뛰는 경우가 많습니다. 공제를 받으려면 회사에 내는 연말정산 서류와 별도로 가입한 은행에 확인서를 내야 한다는 점도 놓치기 쉽습니다.

이 글에서는 주택청약종합저축 납입액에 대한 소득공제를 누가 받을 수 있는지, 무주택과 세대주 여부를 언제 기준으로 판단하는지, 연 300만원 납입 한도와 40% 공제율로 실제 세금이 얼마나 줄어드는지 정리합니다. 아울러 무주택확인서 제출 기한, 전세자금대출 원리금상환액 공제와 겹치는 한도, 연말에 부족분을 몰아 넣을 때 따져 볼 점과 해지할 때의 추징까지 살펴봅니다. 금액과 요건은 2026년 10월 현재 시행 중인 조세특례제한법과 소득세법을 기준으로 합니다.

상담 사례

사례 ① 세대주가 아닌 배우자 명의 통장
회사원 A씨(34세)는 2025년 4월 결혼해 남편이 세대주로 있는 전셋집에서 살고 있습니다. 부부 모두 주택을 소유한 적이 없습니다. A씨는 2019년에 가입한 본인 명의 청약통장에 매달 10만원씩 넣어 왔고, 2026년 1월부터 10월까지 100만원을 납입했습니다. 올해 예상 총급여는 4,600만원이고, 남편(총급여 약 5,900만원)도 자기 명의 통장에 매달 20만원씩 넣고 있습니다. A씨는 세대주가 아니라 공제 대상이 아니라고 알고 있었는데, 배우자도 공제받을 수 있다는 이야기를 들었습니다. 12월에 남은 금액을 한꺼번에 넣어 300만원을 채우면 전액 공제되는지, 무주택확인서는 언제 어디에 내야 하는지 궁금합니다.

사례 ② 올해 초 집을 팔고 전세로 옮긴 세대주
회사원 B씨(44세)는 지방에 있던 소형 아파트 한 채를 2026년 2월에 팔고, 3월부터 수도권에서 전세자금대출을 받아 전세로 살고 있습니다. 가족과 함께 사는 세대주이고, 세대원 중 다른 주택 소유자는 없습니다. 2015년에 가입한 청약통장에는 매달 10만원씩 넣고 있습니다. 올해 예상 총급여는 6,800만원 안팎인데 연말 상여에 따라 조금 달라질 수 있습니다. 전세자금대출 원리금은 연 900만원가량 갚을 예정입니다. B씨는 12월 31일 현재 무주택이니 올해부터 청약통장 공제를 받을 수 있다고 보고, 12월에 300만원을 채워 넣을 생각입니다.

결론부터 정리하면

• 대상은 근로소득자입니다 — 일용근로자를 제외한 근로소득자로서 해당 과세기간의 총급여액이 7천만원 이하이고, 무주택 세대의 세대주 또는 세대주의 배우자여야 합니다. 배우자는 2025년 1월 1일 이후 납입분부터 대상에 포함되었습니다.
• 연 300만원까지 넣은 금액의 40%를 공제합니다 — 소득공제액은 최대 120만원이고, 실제로 줄어드는 세금은 본인의 한계세율에 따라 달라집니다. 현행법은 2028년 12월 31일까지 납입한 금액을 대상으로 합니다.
• 판정 시점이 두 가지입니다 — 세대주 또는 배우자에 해당하는지는 과세기간 종료일(12월 31일) 현재로 판단하지만, 무주택 요건은 법문상 해당 과세기간 중 주택을 소유하지 않아야 합니다.
• 무주택확인서는 은행에 냅니다 — 공제를 받으려는 과세기간의 다음 연도 2월 말까지 통장을 가입한 저축 취급기관에 제출해야 합니다.
• 전세자금대출 공제와 한도를 나눠 씁니다 — 주택임차차입금 원리금상환액 공제와 합친 금액이 연 400만원을 넘으면 초과분은 공제되지 않습니다.
• 해지하면 추징될 수 있습니다 — 가입일부터 5년 이내에 해지하거나 국민주택규모를 초과하는 주택에 당첨되면 공제 적용 이후 납입액 누계의 6%를 추징합니다.

공제 대상과 공제 금액

• 근로소득이 있을 것 — 공제는 근로소득금액에서 빼는 방식이므로 근로소득이 있는 거주자만 받을 수 있습니다. 일용근로자는 제외되고, 사업소득만 있는 사람도 대상이 아닙니다.
• 총급여 7천만원 이하 — 연봉 계약액이 아니라 근로소득에서 비과세소득을 뺀 총급여액으로 판단합니다. 2026년 현재 월 20만원까지 비과세되는 식대처럼 비과세 급여는 빼고 계산합니다. 기준은 공제받으려는 바로 그 연도의 총급여입니다.
• 무주택 세대의 세대주 또는 세대주의 배우자 — 종전에는 세대주만 가능했지만 2025년 1월 1일 이후 납입하는 금액부터 세대주의 배우자도 공제 대상이 되었습니다.
• 대상 상품 — 주택법에 따른 주택청약종합저축입니다. 청년우대형 주택청약종합저축도 주택청약종합저축이므로 같은 공제 요건이 적용됩니다.
• 공제액 계산 — 해당 연도 납입액(연 300만원 한도) × 40%입니다. 300만원을 넘게 넣어도 공제 계산에는 300만원까지만 반영됩니다. 납입 한도는 2024년 납입분부터 연 240만원에서 300만원으로 늘었습니다.
• 세금 감소 효과 — 최대 120만원의 소득공제에 한계세율을 곱한 만큼 세금이 줄어듭니다. 2026년 현재 세율로 과세표준이 1,400만원 초과 5,000만원 이하인 15% 구간이면 소득세 18만원과 지방소득세 1만 8천원을 합해 약 19만 8천원, 24% 구간이면 약 31만 7천원 수준입니다.

사례 ①의 A씨는 세대주는 아니지만 무주택 세대주의 배우자입니다. 2026년 납입분은 배우자 확대 규정이 적용된 이후의 납입액이므로 공제 대상이 됩니다. 총급여가 7천만원 이하인 근로소득자라는 요건도 갖추고 있습니다. 남편도 같은 세대의 세대주로서 본인 총급여가 7천만원 이하이므로, 부부가 각자 자기 명의 통장에 넣은 금액으로 각각 공제를 검토할 수 있습니다. 법문에 한 세대에서 한 사람만 받도록 제한하는 문구는 없지만, 두 사람 모두 무주택확인서 제출을 비롯한 요건을 각자 갖춰야 합니다.

무주택과 세대주, 판정 시점이 다릅니다

• 세대의 범위 — 본인과 배우자, 같은 주소에서 생계를 같이하는 본인과 배우자의 직계존비속(그 배우자 포함) 및 형제자매를 모두 포함합니다. 부부는 따로 살아도 같은 세대로 보고, 부부가 각각 세대주로 등록되어 있으면 그중 한 사람만 세대주로 봅니다.
• 무주택은 세대 전체 기준 — 본인 명의 주택이 없어도 함께 사는 부모나 배우자가 주택을 가지고 있으면 무주택 세대가 아닙니다.
• 세대주 여부는 12월 31일 현재 — 법은 세대주 또는 배우자에 해당하는지를 과세기간 종료일 현재로 판단하도록 정하고 있습니다. 연중에 세대를 분리했거나 결혼했다면 연말 상태가 기준입니다.
• 무주택 여부는 과세기간 중 — 공제 요건 문구가 해당 과세기간 중 주택을 소유하지 않은 세대로 되어 있고, 국토교통부가 무주택 여부를 확인하는 시기도 공제받으려는 과세기간 중으로 정해져 있습니다. 연중 일부 기간이라도 세대가 주택을 소유했다면 그해 납입분은 공제받기 어렵다고 보아야 합니다.
• 전세자금대출 공제와의 차이 — 소득세법상 주택임차차입금 원리금상환액 공제는 과세기간 종료일 현재 주택을 소유하지 않은 세대를 기준으로 합니다. 같은 사람이라도 두 공제의 결론이 갈릴 수 있습니다.

사례 ②의 B씨가 바로 이 지점에서 걸립니다. 2026년 1월부터 2월까지는 아파트를 소유하고 있었으므로 2026년은 과세기간 중 주택을 소유하지 않은 해가 아닙니다. 12월 31일 현재 무주택이더라도 올해 청약통장 납입분은 공제 대상이 아니라고 보는 것이 법문에 맞습니다. 반면 전세자금대출 원리금상환액 공제는 연말 현재 무주택이면 되므로, 대출이 법정 요건을 갖추었다면 올해부터 받을 수 있습니다. B씨의 청약통장 공제는 1월 1일부터 무주택 상태로 시작하는 2027년 납입분부터, 그해 총급여 등 다른 요건을 함께 갖출 때 가능합니다.

무주택확인서 제출과 연말정산 절차

• 제출처 — 회사가 아니라 통장을 가입한 저축 취급기관입니다. 창구 외에 인터넷·모바일 뱅킹으로 제출할 수 있는지는 은행마다 다르므로 미리 확인합니다.
• 제출 기한 — 소득공제를 받으려는 과세기간의 다음 연도 2월 말까지입니다. 2026년 납입분이라면 2027년 2월 말이 기한입니다.
• 이후 확인 절차 — 은행은 제출자 명단을 다음 연도 3월 5일까지 국토교통부에 보내고, 국토교통부는 공제받으려는 과세기간 중 무주택 세대의 세대주 또는 배우자였는지 확인해 다음 연도 4월 30일까지 국세청과 은행에 알립니다. 요건에 맞지 않는 공제는 이 단계에서 드러납니다.
• 회사에 낼 서류 — 연말정산 간소화 자료에 납입 내역이 조회되지 않으면 은행에서 납입증명서를 발급받아 소득·세액공제신고서와 함께 제출합니다.
• 매년 다시 내야 하는지 — 조문은 제출 기한을 '소득공제를 적용받으려는 과세기간의 다음 연도 2월 말'로 정하고, 공제 대상 납입액을 그 과세기간 이후에 넣은 금액으로 한정합니다. 처음 공제받으려는 해를 기준으로 확인서를 내는 구조로 읽히지만, 한 번 낸 확인서로 이후 연도까지 처리되는지는 법문에 명시되어 있지 않습니다. 가입 은행에 제출 이력이 남아 있는지 해마다 확인하고, 은행을 옮겼거나 해지 후 다시 가입했다면 새로 내는 편이 안전합니다.

사례 ①의 A씨는 2026년 납입분을 공제받으려면 2027년 2월 말까지 본인 통장이 있는 은행에 무주택확인서를 내야 합니다. 회사 연말정산이 2월 급여에서 마무리되더라도 은행 제출은 별개 절차이므로 1월 중에 함께 처리하는 것이 좋습니다. 남편도 본인 통장으로 공제받으려면 자기 가입 은행에 따로 제출해야 합니다.

연말에 몰아 넣기 전, 따져 볼 것

• 세법은 연간 합계만 봅니다 — 공제 대상은 해당 과세기간에 납입한 금액이므로, 매달 나눠 넣든 12월에 한꺼번에 넣든 연간 300만원 한도 안에서는 공제액이 같습니다.
• 연말까지 기다리는 장점 — 그해 총급여가 7천만원 이하인지, 연중 주택을 취득할 일이 없는지, 12월 31일 현재 세대주나 배우자에 해당하는지가 확정된 뒤에 부족분만 채울 수 있습니다. 총급여가 7천만원을 넘으면 그해 납입액은 1원도 공제되지 않습니다.
• 통장의 납입 규칙 — 주택청약종합저축의 월납입금은 2만원 이상 50만원 이하이고, 이를 넘는 금액은 저축 총액이 민영주택 청약 예치기준금액의 최고한도를 넘지 않는 범위에서 다음 회차를 미리 내는 선납으로 처리됩니다. 선납은 월납입금 24회분까지만 인정되고, 청약에서 인정되는 납입 횟수는 가입일부터 모집공고일까지 원래 내야 했던 횟수를 넘지 못합니다.
• 청약 순위에서는 효과가 다릅니다 — 청약에서 쓰는 납입 횟수와 저축총액은 월 단위로 셉니다. 국민주택 청약의 저축총액은 한 달 납입액이 25만원을 넘어도 25만원까지만 인정합니다. 연말 일시 납입은 세금에는 같은 효과를 내지만 청약 실적으로는 매달 꾸준히 넣은 것과 같게 평가되지 않습니다.
• 매달 25만원이 맞물리는 지점 — 월 25만원씩 12개월을 넣으면 정확히 300만원이 되어, 소득공제 한도와 국민주택 청약의 월 인정 한도를 함께 채울 수 있습니다.
• 입금 시점 — 12월 31일까지 입금이 끝나야 그해 납입액이 됩니다. 마지막 날에는 이체 시간 제한이나 전산 점검이 있을 수 있으므로 며칠 여유를 두고, 선납으로 처리된 금액이 그해 납입증명서에 반영되는지 확인합니다.
• 다른 주택 공제와 한도 공유 — 주택임차차입금 원리금상환액 공제와 합쳐 연 400만원, 여기에 장기주택저당차입금 이자상환액 공제까지 더하면 연 800만원(차입 요건에 따라 600만원~2,000만원)이 종합 한도입니다.

사례 ①의 A씨는 11월과 12월 정기 납입분 20만원을 더하면 연간 120만원이 되므로, 12월 중순까지 180만원을 추가로 넣으면 300만원 한도를 채웁니다. 소득공제액은 120만원이고, 15% 구간이라면 지방소득세를 포함해 약 19만 8천원의 세금이 줄어듭니다. 다만 추가 입금분은 월납입금을 넘는 선납으로 처리되므로 청약 실적상으로는 앞으로의 회차를 미리 낸 것이 됩니다. A씨가 공공분양 청약을 염두에 두고 있다면 내년부터는 월 25만원 자동이체로 바꾸는 편이 세금과 청약 인정액을 함께 챙기는 방법입니다.

사례 ②의 B씨는 올해 300만원을 몰아 넣어도 세금이 줄지 않으므로, 올해 납입액은 청약 전략만 보고 정하면 됩니다. 2027년에도 따져 볼 것이 있습니다. 전세자금대출 원리금 900만원의 40%인 360만원이 이미 공제되는데, 청약통장 공제 120만원을 더하면 합계가 480만원이 되어 400만원 한도를 80만원 넘습니다. 청약통장 납입으로 실제 늘어나는 공제는 40만원에 그칩니다. 총급여도 7천만원 경계에 가까우므로 연말 상여까지 반영된 금액을 확인한 뒤 12월에 납입액을 정하는 것이 합리적입니다.

해지하면 돌려줘야 하는 경우

• 같은 해 중도해지 — 과세기간 중에 통장을 해지하면 그해 납입액은 공제되지 않습니다. 다만 주택 당첨, 청년우대형 통장으로의 전환, 해지 전 6개월 이내의 퇴직·폐업·3개월 이상의 입원치료 같은 사유는 예외입니다.
• 가입일부터 5년 이내 해지 — 공제를 받은 사람이 가입일부터 5년 안에 해지하면, 은행이 해지할 때 추징세액을 떼어 냅니다. 사망, 해외이주, 국민주택규모 주택 당첨, 위의 특별 사유로 해지하는 경우는 제외되며, 특별해지사유신고서를 은행에 내야 합니다.
• 국민주택규모 초과 주택 당첨 — 주택법에 따른 사업계획승인을 받아 건설되는 국민주택규모(주거전용면적 85㎡ 이하가 기본)를 초과하는 주택에 당첨되면, 가입 기간과 관계없이 추징 대상이 됩니다.
• 추징세액 — 공제를 적용받은 과세기간 이후 납입한 금액(연 300만원 한도)의 누계액 × 6%입니다. 실제로 감면받은 세액이 이보다 적다는 것을 증명하면 그 금액만 추징합니다.
• 6%의 의미 — 납입액의 40%를 공제받은 사람이 15% 세율 구간에서 얻는 절세 효과가 납입액의 6%입니다. 세율 구간이 낮았거나 공제를 받지 못한 해가 섞여 있다면 실제 감면세액 기준으로 줄일 여지가 있으므로 연도별 원천징수영수증을 보관해 두어야 합니다.

사례 ①의 A씨와 사례 ②의 B씨는 모두 가입한 지 5년이 지났으므로 일반 해지에 따른 추징은 걱정하지 않아도 됩니다. 다만 B씨가 2027년부터 공제를 받다가 이후 전용면적 85㎡를 넘는 민영주택에 당첨되면 공제를 받은 이후의 납입액을 기준으로 추징이 이루어집니다. 큰 평형 청약을 계획하고 있다면 절세액과 추징액을 함께 놓고 공제를 받을지 판단해야 합니다.

이런 대응은 오히려 위험합니다

• 12월 31일 하루만 무주택이면 된다고 보고 연초에 판 집이나 연중에 산 집을 신경 쓰지 않는 것 — 국토교통부의 무주택 확인 단계에서 걸려 공제가 부인되고 가산세가 붙을 수 있습니다.
• 연말정산 서류만 회사에 내고 은행에 무주택확인서를 내지 않는 것 — 제출 기한이 법에 정해져 있어 공제가 인정되지 않을 수 있습니다.
• 전세자금대출 원리금 공제를 이미 많이 받으면서 청약통장 공제도 따로 전액 받는다고 계산하는 것 — 두 공제를 합친 400만원 한도에 걸립니다.
• 함께 사는 부모나 배우자의 주택 보유를 확인하지 않고 본인 명의만 따지는 것 — 무주택 여부는 세대 전체로 판단합니다.
• 공제를 받던 통장을 가입 5년 안에, 특히 같은 해에 해지하는 것 — 그해 공제가 사라지는 데 더해 이전 공제분이 추징될 수 있습니다.

자주 묻는 질문

Q. 올해 12월에 집 잔금을 치르면 올해 넣은 돈은 공제되나요?
과세기간 중 주택을 소유하게 되므로 법문대로라면 올해 납입분은 공제 요건을 갖추지 못한다고 보아야 합니다. 전세자금대출 원리금상환액 공제도 12월 31일 현재 주택을 소유하고 있으면 받을 수 없습니다. 소유권을 취득하는 시점이 해를 넘기면 결론이 달라질 수 있으므로, 잔금과 등기 일정을 정할 때 이 부분도 함께 확인하는 것이 좋습니다.

Q. 프리랜서로 3.3%를 떼고 받는데 공제를 받을 수 있나요?
이 공제는 근로소득금액에서 빼는 구조라 사업소득만 있는 사람은 대상이 아닙니다. 회사에 다니면서 부업으로 사업소득이 있는 사람은 근로소득에 대해 요건을 갖추면 공제를 받을 수 있습니다. 이때 총급여 7천만원 기준은 근로소득의 총급여로 판단합니다.

Q. 작년에 배우자 명의 통장 공제를 빠뜨렸다면 지금이라도 받을 수 있나요?
연말정산에서 빠뜨린 공제는 일반적으로 법정신고기한부터 5년 이내에 경정청구로 바로잡을 수 있습니다. 다만 이 공제는 무주택확인서를 다음 연도 2월 말까지 은행에 내도록 기한이 법에 정해져 있으므로, 그 기한 안에 제출했는지가 먼저 문제 됩니다. 제출하지 못했다면 인정 여부를 개별적으로 확인해야 하고, 올해분부터는 기한을 지키는 것이 확실한 방법입니다.

Q. 300만원을 넘게 넣으면 손해인가요?
손해는 아니고, 300만원을 넘는 금액은 소득공제 계산에 반영되지 않을 뿐입니다. 민영주택 청약의 예치금이나 이자 측면에서는 의미가 있을 수 있으므로, 세금만이 아니라 청약 계획에 맞춰 정하면 됩니다.

체크리스트

• 올해 총급여(비과세 급여 제외)가 7천만원 이하인지 12월 급여명세서와 상여 지급 일정으로 확인합니다.
• 함께 사는 세대원을 포함해 1월 1일부터 연말까지 주택을 소유한 사람이 없었는지, 연내 매매 계획은 없는지 점검합니다.
• 12월 31일 현재 본인이 세대주 또는 세대주의 배우자에 해당하는지 주민등록 상태를 확인합니다.
• 올해 납입액을 조회해 300만원까지 부족한 금액을 계산하고, 전세자금대출 원리금 공제와 합친 400만원 한도에 여유가 있는지 봅니다.
• 부족분은 12월 중순까지 입금하고, 선납으로 처리된 금액이 올해 납입증명서에 잡히는지 확인합니다.
• 내년 2월 말까지 가입 은행에 무주택확인서를 제출하고, 연말정산 때 납입증명서와 공제신고서를 회사에 냅니다.
• 해지나 큰 평형 청약을 계획하고 있다면 가입일부터 5년이 지났는지, 추징 대상이 되는지 먼저 따져 봅니다.

청약통장 소득공제는 금액만 보면 크지 않지만, 무주택 기간이 긴 근로자에게는 해마다 반복해서 받을 수 있는 공제입니다. 다만 세대주 여부는 연말 하루로, 무주택 여부는 한 해 전체로 판단하고, 제출 서류는 회사가 아니라 은행으로 간다는 점에서 다른 공제와 구조가 다릅니다. 연말에 집을 사고팔 계획이 있다면 일정을 정하기 전에 이 공제와 전세자금대출 공제가 어떻게 달라지는지부터 확인하고, 무주택이 확실한 해라면 부족분을 채우고 2월 말까지 확인서를 내는 것으로 마무리하면 됩니다.